海水源熱泵作為一種新型的制冷供暖方式，從技術的角度，尤其是熱泵機組的角度上看是相當成熟的。但考慮到中國的國情，以及將海水源熱泵制冷供暖作為一個整體的系統工程來推廣應用時，還存在一些問題：
1 、水源系統方面 水源系統的取水量、取水溫度、水質和供水穩定性是影響水源熱泵系統運行效果的重要因素。就水源取水這方面來說: 供回水口位置的優化選擇問題亟待研究，以指導實際工程上敷設供回水管道。
2 、投資的經濟性 由于受到不同地區、不同用戶及國家能源政策、燃料價格的影響，水源的基本條件不同；一次性投資及運行費用會隨著用戶的不同而有所不同。雖然總體來說，海水源熱泵的運行效率較高。但與傳統的空調制冷取暖方式相比，在不同地區不同需求的條件下，海水源熱泵的投資經濟性會有所不同。尤其是在前端的水源系統方面，海水供回水管道的敷設位置（距海岸距離及距海底深度）及敷設方式(垂直于海流方向及與海流同向)與其在工程投資方面的實際造價之間的經濟性問題值得深入研究。
3 、整體系統的設計 海水源熱泵的節能作為一個系統，必須從各個方面考慮，如果水源熱泵機組可以做到利用較小的水流量提供更多的能 量，但系統設計對水泵等耗能設備選型不當或控制不當，也會降低系統的節能效果。同樣，若機組提供了高水溫，但設計的節能裝備的末端未加以相應的考慮，也可能會使整個系統的效果降低，或者使得整個系統的初投資增加。所以，水源熱泵的推廣應用，需要更多的各個專業各個領域的人來共同努力共同配合，從政府政策、機組的設計制造、系統的設計和運行管理等各個方面來共同考慮。
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